RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 PRELID3AQ96N28 172 aa-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 AP1S3Q96PC3 154 aa-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.09□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-0.1□□□□□ -2.42
ITGA4-211ENST00000490435 MYH1P12882 1939 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1W2PPB8 328 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1W2PRS3 328 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 PRORSD1PA6NEY8 169 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 KIR3DP1A8MWS1 328 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 SERPINB1P30740 379 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 MAXP61244 160 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF56Q15929 161 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 C3orf33Q6P1S2 294 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 CDC26Q8NHZ8 85 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.1□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 PIEZO1Q92508 2521 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 TTC28Q96AY4 2481 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 KDM6BO15054 1643 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 PPP5D1E7EU14 171 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 IGF2P01344 180 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 BCL2P10415 239 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 S100A11P31949 105 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 SDC2P34741 201 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM78Q5T7P6 136 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 GID8Q9NWU2 228 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 MPC1Q9Y5U8 109 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.11□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA1O95477 2261 aa-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 COL7A1Q02388 2944 aa-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 ARL5CA6NH57 179 aa-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 CCSMST1Q4G0I0 132 aa-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.12□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 ROCK1Q13464 1354 aa-0.13□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 BBIP1A8MTZ0 92 aa-0.13□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 DNAJB13P59910 316 aa-0.13□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-0.13□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 MORN4Q8NDC4 146 aa-0.13□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 C19orf12Q9NSK7 152 aa-0.13□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 COMMD3Q9UBI1 195 aa-0.13□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa-0.14□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 STX12Q86Y82 276 aa-0.14□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 ARL17AQ8IVW1 177 aa-0.14□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 TEX29Q8N6K0 151 aa-0.14□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-0.14□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 DLEC1Q9Y238 1755 aa-0.14□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1W2PRE2 83 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 HIGD1CA8MV81 97 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 SLC25A4P12235 298 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 G0S2P27469 103 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 TRIQKQ629K1 86 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 HRCT1Q6UXD1 115 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 RREB1Q92766 1687 aa-0.15□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.16□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.16□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 WDR97A6NE52 1622 aa-0.16□□□□□ -2.43
ITGA4-211ENST00000490435 LYPD5Q6UWN5 251 aa-0.16□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-0.16□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 PROK2Q9HC23 129 aa-0.16□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 MED31Q9Y3C7 131 aa-0.16□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 A0A096LNT2 108 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 IFITM5A6NNB3 132 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 E5RI56 91 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 H3BMG7 143 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 FXYD1O00168 92 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 CDC42EP2O14613 210 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 IGKCP01834 107 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 CD3DP04234 171 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 GNG10P50151 68 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 THEM6Q8WUY1 208 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 LXNQ9BS40 222 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC32Q9BV29 185 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 SPAG17Q6Q759 2223 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.17□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 CPDO75976 1380 aa-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 POLQO75417 2590 aa-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM189A5PLL7 270 aa-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 TPST1O60507 370 aa-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 CRYGSP22914 178 aa-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 BLCAPP62952 87 aa-0.18□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms