RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487270.5

RAD51B-210, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 2,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-210ENST00000487270 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.12□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 DTX2Q86UW9 622 aa5.12□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 RNF185Q96GF1 192 aa5.12□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.12□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.12□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.12□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 DKK2Q9UBU2 259 aa5.12□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 SPG11Q96JI7 2443 aa5.12□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 LY6DQ14210 128 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 AJUBAQ96IF1 538 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 CCDC140Q96MF4 163 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 CD5LO43866 347 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 S100A7P31151 101 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 LEPP41159 167 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.11□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 C7orf71A4D174 169 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 PRSS1P07477 247 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 FGF6P10767 208 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 PAX8Q06710 450 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 PCP2Q8IVA1 136 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 METTL26Q96S19 204 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 CITED1Q99966 193 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 TRGV3P03979 118 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 RAB9AP51151 201 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 EFNA4P52798 201 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 LMO4P61968 165 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 RNF151Q2KHN1 245 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 NPFFO15130 113 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 SPRY2O43597 315 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 LINC01559Q495D7 138 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.1□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.591e-8■■■■□ 25.9
RAD51B-210ENST00000487270 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 A1L4Q6 167 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 PPBPP02775 128 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 IGF1P05019 195 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 RBX1P62877 108 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 ATP5G2Q06055 141 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 RAB37Q96AX2 223 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 C16orf92Q96LL3 132 aa5.09□□□□□ -1.59
RAD51B-210ENST00000487270 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 K7EP13 123 aa5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 FCER1GP30273 86 aa5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 DEFB1P60022 68 aa5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 AP1S3Q96PC3 154 aa5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 CNFNQ9BYD5 112 aa5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 RBAKDNA6NC62 111 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 SEC11AP67812 179 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 DPF1Q92782 380 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 FOXC2Q99958 501 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 GAGE10A6NGK3 116 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 H3BUT2 72 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 H3BVH4 76 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 C19orf84I3L1E1 186 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 TRBV12-3P01733 135 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 IGHV3-11P01762 117 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 KIR3DS1Q14943 382 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 LY6EQ16553 131 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.08□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 ACACBO00763 2458 aa5.07□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.07□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 GAGE12BA1L429 117 aa5.07□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 A6NDN8 102 aa5.07□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 SMIM17P0DL12 118 aa5.07□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 PRR9Q5T870 116 aa5.07□□□□□ -1.6
RAD51B-210ENST00000487270 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms