RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.72□□□□□ -1.01
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RABGEF1-207ENST00000484547 G0S2P27469 103 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-207ENST00000484547 AMTP48728 403 aa8.71□□□□□ -1.02
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RABGEF1-207ENST00000484547 CT83Q5H943 113 aa8.71□□□□□ -1.02
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RABGEF1-207ENST00000484547 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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RABGEF1-207ENST00000484547 ST20Q9HBF5 79 aa8.66□□□□□ -1.02
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RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF492Q9P255 531 aa8.66□□□□□ -1.02
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RABGEF1-207ENST00000484547 F2Z2F3 143 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-207ENST00000484547 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-207ENST00000484547 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2V1Q13404 147 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZN92 141 aa8.65□□□□□ -1.02
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