RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 E5RGE8 158 aa13.16□□□□□ -0.3
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SHQ1-206ENST00000471526 OTORQ9NRC9 128 aa13.04□□□□□ -0.32
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SHQ1-206ENST00000471526 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.03□□□□□ -0.32
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SHQ1-206ENST00000471526 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.03□□□□□ -0.32
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SHQ1-206ENST00000471526 TMED6Q8WW62 240 aa13.03□□□□□ -0.32
SHQ1-206ENST00000471526 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.02□□□□□ -0.33
SHQ1-206ENST00000471526 K7EP13 123 aa13.02□□□□□ -0.33
SHQ1-206ENST00000471526 SSNA1O43805 119 aa13.02□□□□□ -0.33
SHQ1-206ENST00000471526 TDRG1Q3Y452 100 aa13.02□□□□□ -0.33
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