RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 STPG4Q8N801 248 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 C9orf85Q96MD7 179 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 AMELYQ99218 206 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 WIPF3A6NGB9 483 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 PYYP10082 97 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 HERV-K104P63124 156 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 CTAG1AP78358 180 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 TFF3Q07654 80 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 A0A1B0GTL3 188 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 RS1O15537 224 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 UBE2D2P62837 147 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 CRYGDP07320 174 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 GFI1Q99684 422 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 NDUFA1O15239 70 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 CT83Q5H943 113 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 SFTA2Q6UW10 78 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 CACNA1HO95180 2353 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 SH2D1AO60880 128 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 PCP2Q8IVA1 136 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 CDH23Q9H251 3354 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 HERVK_113P63121 156 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CENPF-201ENST00000366955 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 DEFB4AO15263 64 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 NOTCH4Q99466 2003 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 NPBQ8NG41 125 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 SIGMAR1Q99720 223 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 KLK12Q9UKR0 248 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PRE2 83 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 A8MXK9 166 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 CRYGCP07315 174 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 C5orf38Q86SI9 138 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 CD177Q8N6Q3 437 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 MLST8Q9BVC4 326 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 ROS1P08922 2347 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGKV4-1P06312 121 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 C2orf82Q6UX34 121 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 ATOH7Q8N100 152 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 RNF152Q8N8N0 203 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 LTAP01374 205 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGHG4P01861 327 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 ZNF134P52741 427 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 CCL20P78556 96 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 HGFACQ04756 655 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 SMPXQ9UHP9 88 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 SDK2Q58EX2 2172 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 NOTCH2Q04721 2471 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 A0A087X0M5 115 aa3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 A0A1B0GX30 115 aa3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 H3BQ85 93 aa3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 MGST2Q99735 147 aa3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 TRACP01848 142 aa3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CENPF-201ENST00000366955 TDRG1Q3Y452 100 aa3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.2 ms