RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TREM1Q9NP99 234 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 NMBP08949 121 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 RRN3P1Q2M238 152 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 MUC21Q5SSG8 566 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 DERL1Q9BUN8 251 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 MANBALQ9NQG1 85 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 H7BYZ3 331 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 K7EQM0 130 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 BCL2P10415 239 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R60P59551 318 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 BLOC1S1P78537 153 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 Q86TA4 180 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 IL17DQ8TAD2 202 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 PPT1P50897 306 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 PMS2P11Q13670 270 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 Q6AWC8 147 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 GCGP01275 180 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 AKR1C3P42330 323 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 CRIP1P50238 77 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 MUC7Q8TAX7 377 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 IFITM2Q01629 132 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf52Q96A22 123 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 FMC1Q96HJ9 113 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 DKK2Q9UBU2 259 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 VAX2Q9UIW0 290 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 NAGKQ9UJ70 344 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 RGS13O14921 159 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 LTAP01374 205 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 UBE2G1P62253 170 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 C12orf74Q32Q52 190 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TOR2AQ5JU69 321 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZTC4 211 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 RAB19A4D1S5 217 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 CBY3A6NI87 242 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 GNRH2O43555 120 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 IFNA1P01562 189 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 SMUG1Q53HV7 270 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 MDFICQ9P1T7 246 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 CXorf65A6NEN9 183 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 C16orf74Q96GX8 76 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM189A5PLL7 270 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 PDE6DO43924 150 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 CASC10Q5T4H9 136 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF575Q86XF7 245 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 BAGE2Q86Y30 109 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 FAM210AQ96ND0 272 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 MLST8Q9BVC4 326 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 MED9Q9NWA0 146 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-201ENST00000309641 C9JQL5 133 aa6.46□□□□□ -1.38
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