RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.54□□□□□ -0.56
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CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV2-23P01705 113 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRGV3P03979 118 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 LYNX1P0DP58 116 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR25Q96S07 402 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 LHBP01229 141 aa11.54□□□□□ -0.56
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TM2D2Q9BX73 214 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC25A16P16260 332 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 HIGD1BQ9P298 99 aa11.54□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 LAGE3Q14657 143 aa11.53□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.53□□□□□ -0.56
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CCNDBP1-201ENST00000300213 A6NJY4 79 aa11.53□□□□□ -0.56
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CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.52□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-201ENST00000300213 GAGE2EQ4V326 116 aa11.52□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.52□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.52□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.51□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C9JAW5 83 aa11.51□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV4-39P01824 125 aa11.51□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 HERV-K104P63124 156 aa11.51□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.51□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.51□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ZZEF1O43149 2961 aa11.5□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB109BQ30KR1 87 aa11.5□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV1-44P01699 117 aa11.5□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.5□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRBAP50851 2863 aa11.49□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLRD1Q13241 179 aa11.49□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.49□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDIP1Q9H305 208 aa11.49□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.572e-12■■■□□ 16.4
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRYGCP07315 174 aa11.49□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.49□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLEC3BP05452 202 aa11.49□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRSS33Q8NF86 280 aa11.49□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.49□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-201ENST00000300213 H3BRN7 92 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM155Q4W5P6 130 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 SORL1Q92673 2214 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRAC2D3DTV9 90 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 H7C1H1 209 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A087WX48 190 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8N8P6 123 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF185Q96GF1 192 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 F5H697 171 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 GFRALQ6UXV0 394 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZQT7 251 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFHR4Q92496 578 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLNP26678 52 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 MFAP4P55083 255 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 FHL3Q13643 280 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.47□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DLX6P56179 175 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERG28Q9UKR5 140 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 U3KQK5 164 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 I3L2K1 104 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRSS2P07478 247 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 TECTAO75443 2155 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 F8VRH5 84 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF688P0C7X2 276 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSPAN13O95857 204 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCL1BO95988 128 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 CUBNO60494 3623 aa11.45□□□□□ -0.58
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