RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 PDE6HQ13956 83 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 LY6HO94772 140 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 COX7A1P24310 79 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 LINC01559Q495D7 138 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 MED13LQ71F56 2210 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF575Q86XF7 245 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 AGRNO00468 2067 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 CNIH1O95406 144 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 IGLV1-47P01700 117 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 SYT8Q8NBV8 401 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 LINC01560Q8TB33 94 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 ATRXP46100 2492 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 FOXI1Q12951 378 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT11-201ENST00000289382 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 ORM1P02763 201 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 Q8N8P6 123 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 CNFNQ9BYD5 112 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 CDIP1Q9H305 208 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 NDUFA3O95167 84 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 SPINK8P0C7L1 97 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 RPEQ96AT9 228 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 A0A087WX48 190 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 KLRD1Q13241 179 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 DTX2Q86UW9 622 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 IGF2RP11717 2491 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 MT-ATP8P03928 68 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 FHL3Q13643 280 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 NFE4Q86UQ8 179 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 PLNP26678 52 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 HLA-DMBP28068 263 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 CDSNQ15517 529 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 VPS13CQ709C8 3753 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 LAGE3Q14657 143 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT11-201ENST00000289382 EFNA4P52798 201 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 GLMPQ8WWB7 406 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 TIMM23O14925 209 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 OR11H12B2RN74 326 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 LINC01619G3V211 115 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 IGHV3-23P01764 117 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 TRGV3P03979 118 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 XGP55808 180 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 Q6ZUT4 128 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 OR11H1Q8NG94 326 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 OR11H2Q8NH07 326 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 CACNA1BQ00975 2339 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 IGHG4P01861 327 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 FOXC1Q12948 553 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 SFTA2Q6UW10 78 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 F8VRH5 84 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 NRACQ8N912 160 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 F8W735 103 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 CD3EP07766 207 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 COL12A1Q99715 3063 aa14.47□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 LINC01549A6NIU2 74 aa14.47□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 TSPAN13O95857 204 aa14.47□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CNOT11-201ENST00000289382 PSMB2P49721 201 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms