RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.99□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 AVPP01185 164 aa7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 PLP1P60201 277 aa7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 TCF21O43680 179 aa7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM262E9PQX1 116 aa7.98□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 H7C1H1 209 aa7.97□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 CCL24O00175 119 aa7.97□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.97□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.97□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 HBDP02042 147 aa7.97□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 CFHR3Q02985 330 aa7.97□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 GNRH2O43555 120 aa7.97□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.96□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 INSP01308 110 aa7.96□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.96□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.96□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.96□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.96□□□□□ -1.13
TTPAL-201ENST00000262605 CTAG1AP78358 180 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 DNLZQ5SXM8 178 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 PYY3Q5JQD4 70 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 C1orf159Q96HA4 380 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 IGLC2P0DOY2 106 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 PTPN13Q12923 2485 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 Q6YL49 198 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 PPBPP02775 128 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 EBI3Q14213 229 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 CT83Q5H943 113 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00587B1AMM8 73 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 Q8N6K4 173 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 C3orf56Q8N813 242 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 PPP1R17O96001 155 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 CDKN1BP46527 198 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF415Q09FC8 603 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 LAGE3Q14657 143 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 CSTL1Q9H114 145 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 TNFRSF6BO95407 300 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 ATP5LO75964 103 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 TYMSP04818 313 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 C3orf79P0CE67 100 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF876PQ49A33 203 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 A8MWP6 167 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 CD28P10747 220 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 GCSHP23434 173 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 RAB37Q96AX2 223 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 hDV102S1A0JD36 115 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 C2orf70A6NJV1 201 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 GTSF1Q8WW33 167 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 SMR3AQ99954 134 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 HIST1H4GQ99525 98 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 FAM231BA6NCW3 169 aa7.91□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 H7C2G1 150 aa7.91□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB130BP0DP73 79 aa7.91□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB130AP0DP74 79 aa7.91□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms