RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 GAGE12FP0CL80 117 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 GAGE12GP0CL81 117 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 GAGE12IP0CL82 117 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 CNTFRP26992 372 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 GATA4P43694 442 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 EFNA4P52798 201 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 UBE2D3P61077 147 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 UBE2D2P62837 147 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 GAGE4Q13068 117 aa5.63□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 IGHV1-46P01743 117 aa5.62□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.62□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 CTSZQ9UBR2 303 aa5.61□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.61□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.61□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 AJUBAQ96IF1 538 aa5.61□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 KLK15Q9H2R5 256 aa5.61□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.61□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.6□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.6□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.6□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.6□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 S4R3C0 116 aa5.6□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 SLC25A16P16260 332 aa5.6□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 ASIPP42127 132 aa5.6□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.6□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 RAX2Q96IS3 184 aa5.6□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 SLC25A20O43772 301 aa5.59□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 CRLF1O75462 422 aa5.59□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 ONECUT1Q9UBC0 465 aa5.59□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 C9JAW5 83 aa5.59□□□□□ -1.52
CSDE1-201ENST00000261443 CLEC3BP05452 202 aa5.59□□□□□ -1.52
CSDE1-201ENST00000261443 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.59□□□□□ -1.52
CSDE1-201ENST00000261443 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.59□□□□□ -1.52
CSDE1-201ENST00000261443 NDUFB3O43676 98 aa5.58□□□□□ -1.52
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