RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 C15orf65H3BRN8 121 aa12.74□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 DTX1Q86Y01 620 aa12.74□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 SPTA1P02549 2419 aa12.74□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 M0R1W7 72 aa12.74□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 PTH2Q96A98 100 aa12.74□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.74□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 RHODO00212 210 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 WDR86Q86TI4 376 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 SIP14410 1827 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 SS18Q15532 418 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 C17orf58Q2M2W7 97 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 FAM223BA6NKX1 122 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 F8WEM9 126 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 IGHG3P01860 377 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 MUSTN1Q8IVN3 82 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 TMEM219Q86XT9 240 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 USMG5Q96IX5 58 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 THBDP07204 575 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZNF134P52741 427 aa12.71□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 PRSS22Q9GZN4 317 aa12.71□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa12.71□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.71□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa12.71□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 GNLYP22749 145 aa12.71□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 LYPD6Q86Y78 171 aa12.71□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 GTSF1Q8WW33 167 aa12.71□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 C22orf46C9J442 243 aa12.71□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 YPEL4Q96NS1 127 aa12.71□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 C17orf77Q96MU5 243 aa12.71□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 ATP5G1P05496 136 aa12.7□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 CRIPAKQ8N1N5 446 aa12.7□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 ABCA1O95477 2261 aa12.7□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 H3BT86 120 aa12.7□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 HERVK_113P63121 156 aa12.7□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.7□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZR03 302 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 DOCK3Q8IZD9 2030 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 CTRLP40313 264 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 TEX36Q5VZQ5 186 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 RHOHQ15669 191 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 TPSG1Q9NRR2 321 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 RNF114Q9Y508 228 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 ABCA7Q8IZY2 2146 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 Q0VFX4 171 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 CFHR4Q92496 578 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 FER1L5A0AVI2 2057 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 F6UB75 175 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PRX2 142 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 IGHG2P01859 326 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 ODF1Q14990 250 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 ZNF491Q8N8L2 437 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 E9PLD3 99 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 PI4KAP42356 2102 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 PSMB8P28062 276 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 C11orf1Q9H5F2 150 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 KLK9Q9UKQ9 250 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 OVOL3O00110 214 aa12.66□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 NBL1P41271 181 aa12.66□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 BRK1Q8WUW1 75 aa12.66□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 NXPH4O95158 308 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 SPINK13Q1W4C9 94 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 LINC00311Q8N616 119 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 CDK2AP2O75956 126 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 DYNAPQ8N1N2 210 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 Q9H8V8 135 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 CRYGBP07316 175 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 GP9P14770 177 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 TET1Q8NFU7 2136 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-201ENST00000256413 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 LINC00643Q86TS7 51 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 DOCK10Q96BY6 2186 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 UQCRQO14949 82 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 PIFOQ8TCI5 191 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-201ENST00000256413 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.64□□□□□ -0.39
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