RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Id3P41133 119 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HykkQ5U5V2 376 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lax1Q8BHB3 407 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab9bQ8BHH2 201 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1102Q8VES2 324 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Poldip2Q91VA6 368 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nicn1Q9CQM0 213 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Coa3Q9D2R6 108 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr609E9Q4X7 319 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4133K9J7G6 307 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd81P35762 236 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col9a1Q05722 921 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il22ra2Q80XF5 230 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TprkbQ8QZZ7 175 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab11fip5Q8R361 645 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chchd1Q9CQA6 118 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cmtm2bQ9DAC0 210 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Timm8a1Q9WVA2 97 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec16aA2AIX1 2377 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Iglv3A0A0B4J1K5 122 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifitm7G3X9Z2 141 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr467L7N455 308 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcgf2P23798 342 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxd11P23813 323 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mib2Q8R516 973 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tm2d1Q99MB3 208 aa13.42□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21719J3KMI9 230 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr12P35412 334 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5868Q8BJG1 145 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vwc2Q8C8N3 324 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1404Q8VGE1 313 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GmppaQ922H4 420 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sptbn2Q68FG2 2388 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20873J3QMQ9 232 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20795J3QP49 232 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pde6dO55057 150 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P04212 136 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifna6P07350 189 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl31P62900 125 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21440Q3TTD8 232 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q6DIA7 600 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fkbp11Q9D1M7 201 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex36Q9D5N9 219 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A0A1L1SR50 188 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr466E9Q2B9 308 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TymsP07607 307 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pate4Q09098 99 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr495Q8VF12 330 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1408Q8VG32 310 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr195Q8VGQ6 308 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prss28Q924N9 274 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gp2Q9D733 531 aa13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eny2Q9JIX0 101 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcrg-V4A0A0B4J1J8 138 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mpig6bD7PDD4 242 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1116E9PXB8 307 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17654F7AXR3 209 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21244J3QK38 227 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtco2P00405 227 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01915 264 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sftpa1P35242 248 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdkn2aQ64364 169 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q6PIU9 354 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smim12Q78RX3 92 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr875Q7TRE5 310 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PpbpQ9EQI5 113 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mef2bO55087 349 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ApohQ01339 345 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sap30lQ5SQF8 182 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1356Q7TQU8 320 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9DAA3 117 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trav6n-7A0A075B6A6 116 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1104A2AVB5 310 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm12169F2Z474 250 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plk3Q60806 631 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rln3Q8CHK2 141 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam174bQ8K064 153 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vstm2aQ8R0A6 236 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cacng8Q8VHW2 423 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hdgfl3Q9JMG7 202 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr132Q9Z282 382 aa13.4□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1245A0A1L1SQJ6 307 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igkv4-51A0N8I8 119 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccl1P10146 92 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sumo1P63166 101 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Siah2Q06986 325 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klk13Q8CGR6 276 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PaxxQ8K0Y7 205 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc37a1Q8R070 531 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mgst1Q91VS7 155 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnps1Q99M28 305 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mien1Q9CQ86 115 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fstl3Q9EQC7 256 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trem3Q9JKE1 183 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igkv14-111A0A140T8P9 117 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hsbp1l1B2RXB2 72 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.5 ms