RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DaoP18894 345 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcl1b2P56841 117 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fabp5Q05816 135 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CcnjQ3TZI6 379 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmub2Q3V209 319 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav6-3Q5R1E6 112 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vdac2Q60930 295 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q80Y39 304 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scgb1b27Q91WB5 92 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl3Q99N95 348 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 S100a14Q9D2Q8 104 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clvs1Q9D4C9 354 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tctex1d1Q9D5I4 173 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CutcQ9D8X1 272 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Copz2Q9JHH9 205 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec6aQ9JKF4 209 aa8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcte2E9PY37 120 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r204I7HIK1 302 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20830J3KML6 227 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mamld1P0C6A2 803 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bdkrb2P32299 392 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf152Q8BG47 203 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10300Q8C8P7 189 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl21eQ8CDZ2 244 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Poc1aQ8JZX3 405 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr958Q8VEY3 312 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1183Q8VFF8 303 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr491Q8VG06 310 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1298Q8VGE6 312 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mus81Q91ZJ0 551 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rchy1Q9CR50 261 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cmss1Q9CZT6 276 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930583I09RikQ9D2E3 102 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hspb9Q9DAM3 168 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccl28Q9JIL2 130 aa8.45□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr33O88416 339 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Iglc3P01845 104 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-Ab1P01921 265 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-DMb1P35737 261 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Runx1Q03347 451 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr598Q7TRR2 319 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r235Q8R297 328 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr860Q8VFF7 317 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1440Q8VFV4 315 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr476Q8VGI4 310 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr661Q99NH4 319 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Msmo1Q9CRA4 293 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Derl3Q9D8K3 228 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex37Q9DAG4 180 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr154Q9QY00 318 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 St6galnac3Q9WUV2 305 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PlpbpQ9Z2Y8 274 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm29106A0A087WSP8 697 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm7929A0A286YDV3 213 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3015F6ZAP6 213 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm7954F7BAX1 213 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IfngP01580 155 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gsta1P13745 223 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnd3P61588 244 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sslp1Q3UN54 99 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtl4Q3URY0 304 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psg25Q497W1 475 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gsta1Q6P8Q0 223 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q6PIU9 354 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vma21Q78T54 101 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr921Q7TRC0 313 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifna12Q80SS5 189 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc16a13Q8CE94 428 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr202Q8VGQ3 307 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tram1Q91V04 374 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lap3Q9CPY7 519 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NepnQ9CQ76 512 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4933414I15RikQ9D4D5 133 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TrirQ9D735 173 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alg5Q9DB25 324 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr61Q9ERF3 305 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf114Q9ET26 229 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SrrQ9QZX7 339 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stub1Q9WUD1 304 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arl3Q9WUL7 182 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A930009A15RikG3UYI6 118 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrygdP04342 174 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P06323 132 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crisp2P16563 243 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hmx3P42581 356 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrygeQ03740 174 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wfdc3Q14AE4 130 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scarb1Q61009 509 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gal3st2Q6XQH0 394 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc17a5Q8BN82 495 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 WrbQ8K0D7 174 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnase2aQ8K196 155 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HscbQ8K3A0 234 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1242Q8VGM6 306 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lcn8Q924P3 175 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atg5Q99J83 275 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.2 ms