Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
CcnjQ3TZI6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
CcnjQ3TZI6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
CcnjQ3TZI6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
CcnjQ3TZI6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
CcnjQ3TZI6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
CcnjQ3TZI6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
CcnjQ3TZI6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
CcnjQ3TZI6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
CcnjQ3TZI6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
CcnjQ3TZI6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
CcnjQ3TZI6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,47■■□□□ 1,83
CcnjQ3TZI6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
CcnjQ3TZI6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
CcnjQ3TZI6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
CcnjQ3TZI6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
CcnjQ3TZI6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
CcnjQ3TZI6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
CcnjQ3TZI6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
CcnjQ3TZI6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
CcnjQ3TZI6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
CcnjQ3TZI6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
CcnjQ3TZI6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
CcnjQ3TZI6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
CcnjQ3TZI6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
CcnjQ3TZI6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
CcnjQ3TZI6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
CcnjQ3TZI6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
CcnjQ3TZI6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
CcnjQ3TZI6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
CcnjQ3TZI6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
CcnjQ3TZI6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
CcnjQ3TZI6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
CcnjQ3TZI6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
CcnjQ3TZI6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
CcnjQ3TZI6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
CcnjQ3TZI6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
CcnjQ3TZI6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
CcnjQ3TZI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
CcnjQ3TZI6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,97■■□□□ 1,59
CcnjQ3TZI6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
CcnjQ3TZI6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
CcnjQ3TZI6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
CcnjQ3TZI6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
CcnjQ3TZI6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
CcnjQ3TZI6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
CcnjQ3TZI6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
CcnjQ3TZI6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
CcnjQ3TZI6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
CcnjQ3TZI6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
CcnjQ3TZI6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
CcnjQ3TZI6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
CcnjQ3TZI6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,57■■□□□ 1,52
CcnjQ3TZI6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
CcnjQ3TZI6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
CcnjQ3TZI6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
CcnjQ3TZI6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
CcnjQ3TZI6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
CcnjQ3TZI6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
CcnjQ3TZI6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
CcnjQ3TZI6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
CcnjQ3TZI6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
CcnjQ3TZI6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
CcnjQ3TZI6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
CcnjQ3TZI6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
CcnjQ3TZI6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
CcnjQ3TZI6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
CcnjQ3TZI6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
CcnjQ3TZI6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
CcnjQ3TZI6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
CcnjQ3TZI6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
CcnjQ3TZI6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,15■■□□□ 1,46
CcnjQ3TZI6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
CcnjQ3TZI6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,14■■□□□ 1,45
CcnjQ3TZI6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
CcnjQ3TZI6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
CcnjQ3TZI6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
CcnjQ3TZI6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
CcnjQ3TZI6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
CcnjQ3TZI6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
CcnjQ3TZI6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
CcnjQ3TZI6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
CcnjQ3TZI6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
CcnjQ3TZI6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
CcnjQ3TZI6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
CcnjQ3TZI6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
CcnjQ3TZI6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
CcnjQ3TZI6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
CcnjQ3TZI6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
CcnjQ3TZI6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
CcnjQ3TZI6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
CcnjQ3TZI6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
CcnjQ3TZI6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
CcnjQ3TZI6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
CcnjQ3TZI6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
CcnjQ3TZI6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
CcnjQ3TZI6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
CcnjQ3TZI6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
CcnjQ3TZI6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
CcnjQ3TZI6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,5 ms