RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	FABP4	P15090	132 aa		0.22	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	SPINK7	P58062	85 aa		0.22	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		0.22	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		0.22	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		0.22	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	ISOC1	Q96CN7	298 aa		0.22	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		0.21	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		0.21	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175		E5RI56	91 aa		0.21	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		0.21	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	CROCCP2	Q86T23	111 aa		0.21	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175		Q86TA4	180 aa		0.21	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		0.21	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	GABARAP	H6UMI1	98 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TRAC	P01848	142 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	BCL2	P10415	239 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	FABP2	P12104	132 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	G0S2	P27469	103 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	GNG10	P50151	68 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	CASC2	Q6XLA1	102 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	USP24	Q9UPU5	2620 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	SPTB	P11277	2137 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	USP54	Q70EL1	1684 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	S100A11	P31949	105 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	FXYD6P3	P58550	94 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	NEDD8	Q15843	81 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TRIQK	Q629K1	86 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PRE2	83 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	SDC2	P34741	201 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	NDUFA6	P56556	154 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	STX12	Q86Y82	276 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	CLEC2B	Q92478	149 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	PRELID3A	Q96N28	172 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	NABP2	Q9BQ15	211 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TNC	P24821	2201 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	C5orf58	C9J3I9	102 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	SULT1C4	O75897	302 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	GYPB	P06028	91 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	CAV3	P56539	151 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	MAX	P61244	160 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	XAF1	Q6GPH4	301 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	CSAG1	Q6PB30	78 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC32	Q9BV29	185 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	DLC1	Q96QB1	1528 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	KDELR1	P24390	212 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	SMPX	Q9UHP9	88 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		0.15	□□□□□ -2.38
ATRX-223	ENST00000637175	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	MORN4	Q8NDC4	146 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	THEM6	Q8WUY1	208 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	LXN	Q9BS40	222 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	MED31	Q9Y3C7	131 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	ANK1	P16157	1881 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PPB8	328 aa		0.14	□□□□□ -2.39

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