RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	CBY3	A6NI87	242 aa		10.15	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.15	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.15	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	hDV102S1	A0JD36	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152		D6R8Y8	96 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC140	Q96MF4	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	TSPO	P30536	169 aa		10.14	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	BUB3	O43684	328 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV4-39	P01824	125 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	ORM1	P02763	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	FXYD7	P58549	80 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	TWIST1	Q15672	202 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152		Q6AWC8	147 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	FA2H	Q7L5A8	372 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		10.13	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	GOSR1	O95249	250 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	OR5AL1	P0C617	328 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	SMKR1	H3BMG3	65 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	PRORY	Q9H606	182 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA1A	O00555	2505 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GW15	77 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152		K7EP13	123 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	NCR2	O95944	276 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	PRELID3A	Q96N28	172 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	BMI1	P35226	326 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	LY6E	Q16553	131 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF575	Q86XF7	245 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	ORMDL3	Q8N138	153 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	VPS25	Q9BRG1	176 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BRF1-222	ENST00000635152	CKS2	P33552	79 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2V1	Q13404	147 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	GATD1	Q8NB37	220 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	METTL26	Q96S19	204 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	TCTA	P57738	103 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5G2	Q06055	141 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF747	Q9BV97	191 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	CENPE	Q02224	2701 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	ACACB	O00763	2458 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	TRGV3	P03979	118 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	PET117	Q6UWS5	81 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZQT7	251 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	GAS8-AS1	O95177	125 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	NPY	P01303	97 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	RAB9A	P51151	201 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	PIFO	Q8TCI5	191 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152		A0A096LNJ9	63 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152		J3KRW8	73 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV12-3	P01733	135 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV1-69	P01742	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGLC6	P0CF74	106 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	PAX8	Q06710	450 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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