RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	CSN1S1	P47710	185 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341		A0A1B0GW15	77 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	GAGE10	A6NGK3	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	IGLL1	P15814	213 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	UQCRFS1	P47985	274 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	LINC01548	A6NM66	108 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341		G3V318	75 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	CTSG	P08311	255 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	FXYD7	P58549	80 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	C15orf32	Q32M92	178 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	hDV102S1	A0JD36	115 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	OR4C46	A6NHA9	309 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	SAA4	P35542	130 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	VGLL1	Q99990	258 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	HAX1	O00165	279 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	PF4V1	P10720	104 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	RIG	Q13278	110 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM219	Q86XT9	240 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341		Q8N9W7	124 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	FAM106CP	P0CH98	169 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	SCGB1A1	P11684	91 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	ID1	P41134	155 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	RABAC1	Q9UI14	185 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	SIVA1	O15304	175 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	SH2D1A	O60880	128 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	CITED1	Q99966	193 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	DEFB125	Q8N687	156 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	TCTA	P57738	103 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	ERCC8	Q13216	396 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	AMN1	Q8IY45	258 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	C19orf84	I3L1E1	186 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341		Q8N6K4	173 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341		D6R8Y8	96 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	SMKR1	H3BMG3	65 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	OVOL3	O00110	214 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
SMTN-222	ENST00000612341	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	CENPE	Q02224	2701 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	ORM1	P02763	201 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	FLNC	Q14315	2725 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	FA2H	Q7L5A8	372 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	PRR25	Q96S07	402 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	PDE6H	Q13956	83 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	TWIST1	Q15672	202 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	NCR2	O95944	276 aa		10	□□□□□ -0.81
SMTN-222	ENST00000612341	GNLY	P22749	145 aa		10	□□□□□ -0.81

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