RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 CRYBA4P53673 196 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF329Q86UD4 541 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 SH2D1AO60880 128 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ADCYAP1P18509 176 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 SAP25Q8TEE9 199 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF492Q9P255 531 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-DRB4P13762 266 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 VWC2Q2TAL6 325 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFA4O00483 81 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 CGB3P0DN86 165 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 TCF15Q12870 199 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 PRR19A6NJB7 356 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 Q8N8P6 123 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 S4R3C0 116 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV2-5P01817 119 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 CGB7P0DN87 165 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 DKK4Q9UBT3 224 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 CTSBP07858 339 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 MST1P26927 711 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 PSMB8P28062 276 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV1-2P23083 117 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 LYPD3O95274 346 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 RHOHQ15669 191 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 NPSP0C0P6 89 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZWC4 215 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 COL4A1P02462 1669 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 F8VRH5 84 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 NPYP01303 97 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 DAD1P61803 113 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 H3BMG7 143 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGLC2P0DOY2 106 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGLC3P0DOY3 106 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 FOXL2P58012 376 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 CELA3BP08861 270 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB125Q8N687 156 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 B4DSR2 109 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 Q86TA4 180 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 RNF185Q96GF1 192 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 QRFPP83859 136 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 E9PLN8 166 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 RBAKDNA6NC62 111 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV1-5P01602 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 CASC2Q6XLA1 102 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 CRYGSP22914 178 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IL17DQ8TAD2 202 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0B4J2C4 111 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PRX2 142 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 NREPQ16612 68 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0U1RRA0 63 aa5.66□□□□□ -1.5
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