RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 C16orf74Q96GX8 76 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 V9GYY9 64 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 ATP6V1G2O95670 118 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 OR2F1Q13607 317 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 NMSQ5H8A3 153 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GGACTQ9BVM4 153 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 ARV1Q9H2C2 271 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 CACNG5Q9UF02 275 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 H3BNG1 76 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GABARAPH6UMI1 98 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GABARAPO95166 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GYPEP15421 78 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 RHOBP62745 196 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35E1Q96K37 410 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 VPS25Q9BRG1 176 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A22Q9H936 323 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 U3KQ87 197 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 RNF222A6NCQ9 220 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 CDS2O95674 445 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 OR5AC1P0C628 307 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 HOXA5P20719 270 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GCSHP23434 173 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 MEF2DQ14814 521 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 NFE4Q86UQ8 179 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 OR52I2Q8NH67 350 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 ISOC2Q96AB3 205 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 C14orf144Q96I85 54 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 A0A087WTM6 91 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE12BA1L429 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1R2P9O14990 202 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE7O76087 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 ORM1P02763 201 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE12FP0CL80 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE12GP0CL81 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE12IP0CL82 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 CAV2P51636 162 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 HAMPP81172 84 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 IFITM2Q01629 132 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 RNF182Q8N6D2 247 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SYT8Q8NBV8 401 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 TERB2Q8NHR7 220 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 NIT2Q9NQR4 276 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 H7BYZ3 331 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 RLN2P04090 185 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 CD3DP04234 171 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 OR10J4P0C629 311 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 S100A7P31151 101 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 TGFBR1P36897 503 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01620Q4KN68 170 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 YIPF6Q96EC8 236 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 GPR82Q96P67 336 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 TRGV9Q99603 122 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 HSPB11Q9Y547 144 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 A0A096LPF7 62 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 SNURFLB1AK76 121 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 HPGDSO60760 199 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 NXPH4O95158 308 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 ORM2P19652 201 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 TBPP20226 339 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 NEDD8Q15843 81 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.22□□□□□ -1.41
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