RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 MYL9P24844 172 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 ATP5G3P48201 142 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 Q8N976 141 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TIMM17AQ99595 171 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 UPK3BQ9BT76 320 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 LPAR5Q9H1C0 372 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 POMPQ9Y244 141 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 S4R3C0 116 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 MYL12BO14950 172 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SOCS1O15524 211 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TSPOP30536 169 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SNCAP37840 140 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 DHRS2Q13268 280 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TDRG1Q3Y452 100 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SSX7Q7RTT5 188 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF555Q8NEP9 628 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 OR4C16Q8NGL9 310 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 PECRQ9BY49 303 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 DIABLOQ9NR28 239 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 DNAH2Q9P225 4427 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 F5H768 121 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 H3BMM0 161 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 K7EIM0 57 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 PDCD5O14737 125 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ATG12O94817 140 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF688P0C7X2 276 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 HLA-DRB4P13762 266 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 CRYBB3P26998 211 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TAS2R46P59540 309 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 QRFPP83859 136 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 PSMG4Q5JS54 123 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 IDNKQ5T6J7 187 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 LINC01551Q86U37 167 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 Q8WTZ3 238 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 A0A096LNJ9 63 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 KNCNA6PVL3 124 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 E7EUB6 86 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ATP8B1O43520 1251 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ATP5HO75947 161 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 FABP1P07148 127 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 PSMB9P28065 219 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ETV6P41212 452 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 CBX5P45973 191 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 PSG9Q00887 426 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 WT1-ASQ06250 92 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 OR10K2Q6IF99 312 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 DCANP1Q8TF63 244 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 BAALCQ8WXS3 180 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 HINT2Q9BX68 163 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 C8orf4Q9NR00 106 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 PKD1P98161 4303 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.43□□□□□ -1.86
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