RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BCP62807 126 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BHQ93079 126 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BNQ99877 126 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BMQ99879 126 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C5orf52A6NGY3 159 aa22.04■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GNB1LQ9BYB4 327 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C2orf70A6NJV1 201 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 M0QZ24 198 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFA7O95182 113 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF138P52744 262 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASL11AQ6T310 242 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLURP1P55000 103 aa22.02■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa22■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1B0GXF2 115 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 K7EQG2 157 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAFAH1B2P68402 229 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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