RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-211ENST00000559460 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD3-211ENST00000559460 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.23□□□□□ -1.41
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SMAD3-211ENST00000559460 A0A0J9YXV3 536 aa6.23□□□□□ -1.41
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SMAD3-211ENST00000559460 RAB31Q13636 194 aa6.21□□□□□ -1.42
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SMAD3-211ENST00000559460 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.21□□□□□ -1.42
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SMAD3-211ENST00000559460 FAM25GB3EWG6 89 aa6.18□□□□□ -1.42
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SMAD3-211ENST00000559460 MUC21Q5SSG8 566 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 AP3S1Q92572 193 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2WQ96B02 151 aa6.18□□□□□ -1.42
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SMAD3-211ENST00000559460 COX7A2P2O60397 106 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 RAB3DO95716 219 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 CRISP2P16562 243 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 ELOBQ15370 118 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 BAK1Q16611 211 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 OR52I2Q8NH67 350 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.17□□□□□ -1.42
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