RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557695.1

HECTD1-218, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD1, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1-218ENST00000557695 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
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HECTD1-218ENST00000557695 NEDD8Q15843 81 aa-0.01□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 IQCJQ1A5X6 159 aa-0.01□□□□□ -2.41
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HECTD1-218ENST00000557695 LYRM7Q5U5X0 104 aa-0.01□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
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HECTD1-218ENST00000557695 LRRC18Q8N456 261 aa-0.02□□□□□ -2.41
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HECTD1-218ENST00000557695 CPDO75976 1380 aa-0.03□□□□□ -2.41
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HECTD1-218ENST00000557695 SMIM23A6NLE4 172 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 RIIAD1A6NNX1 92 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 H7C1C5 153 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 E2F6O75461 281 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 OGNP20774 298 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 S100A11P31949 105 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 RAB5CP51148 216 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 FXYD3Q14802 87 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.03□□□□□ -2.41
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