RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547519.1

HECTD4-205, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 3

Gene HECTD4, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-205	ENST00000547519	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
HECTD4-205	ENST00000547519	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
HECTD4-205	ENST00000547519	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		5.21	□□□□□ -1.57
HECTD4-205	ENST00000547519	CD177	Q8N6Q3	437 aa		5.21	□□□□□ -1.57
HECTD4-205	ENST00000547519	HES7	Q9BYE0	225 aa		5.21	□□□□□ -1.57
HECTD4-205	ENST00000547519	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		5.21	□□□□□ -1.57
HECTD4-205	ENST00000547519	SPRY3	O43610	288 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SAA4	P35542	130 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	APOC4	P55056	127 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519		Q8N8P6	123 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	NABP2	Q9BQ15	211 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	PCNT	O95613	3336 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	C17orf100	A8MU93	164 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	FOXF2	Q12947	444 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	FHL5	Q5TD97	284 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	S1PR3	Q99500	378 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	TMEM243	Q9BU79	118 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	DEPP	Q9NTK1	212 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV1-5	P01602	117 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	FHL2	Q14192	279 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	KISS1	Q15726	138 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	EML5	Q05BV3	1969 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	DEFA4	P12838	97 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	EDDM3B	P56851	147 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	RIG	Q13278	110 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519		K7EMT4	169 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	CCL21	O00585	134 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	BCE1	O60756	84 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV1-39	P01597	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV1D-39	P04432	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	CFC1	P0CG37	223 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	PLN	P26678	52 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	DAND5	Q8N907	189 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SPACA5	Q96QH8	159 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	TAC3	Q9UHF0	121 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	ARID1A	O14497	2285 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	PSPN	O60542	156 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	NGF	P01138	241 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV3-33	P01772	117 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519		P0C879	139 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519		A0A1W2PQD3	144 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519		H7C423	109 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	OVOL3	O00110	214 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SPRY2	O43597	315 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV1D-16	P01601	117 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	CD24	P25063	80 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	MIC13	Q5XKP0	118 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	ZNF714	Q96N38	554 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	PROK2	Q9HC23	129 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		5.15	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		5.15	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519		H7BZZ5	65 aa		5.15	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	TIMM17B	O60830	172 aa		5.15	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	CCK	P06307	115 aa		5.15	□□□□□ -1.58
HECTD4-205	ENST00000547519	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58

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