RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	CD14	P08571	375 aa		0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	SCGB1A1	P11684	91 aa		0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	PRR15	Q8IV56	129 aa		0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	BORCS8	Q96FH0	119 aa		0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	NIT2	Q9NQR4	276 aa		0.48	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	C5orf58	C9J3I9	102 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	DEGS1	O15121	323 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	MT-ND6	P03923	174 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	FABP2	P12104	132 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	S100A11	P31949	105 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	SDC2	P34741	201 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	ALX1	Q15699	326 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	LZIC	Q8WZA0	190 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	PRELID3A	Q96N28	172 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC115	Q96NT0	180 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	OTOR	Q9NRC9	128 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	MED31	Q9Y3C7	131 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	ASB4	Q9Y574	426 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	BCL9	O00512	1426 aa		0.47	□□□□□ -2.33
MDM2-231	ENST00000544125	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SYNM	O15061	1565 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1B0GX51	115 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM189	A5PLL7	270 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	GABARAP	H6UMI1	98 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		J3KT08	172 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TRAC	P01848	142 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SCT	P09683	121 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SPINT3	P49223	89 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	PSPH	P78330	225 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC153	Q494R4	210 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		Q86TA4	180 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	DIRC1	Q969H9	104 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CARD19	Q96LW7	228 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR4C12	Q96R67	309 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	LIMD2	Q9BT23	127 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		0.46	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	RTL9	Q8NET4	1388 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	PHGR1	C9JFL3	82 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		H7BYZ3	331 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	UQCRQ	O14949	82 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SMIM24	O75264	130 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	DPM2	O94777	84 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	IGHV3-33	P01772	117 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	PAEP	P09466	180 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	FABP4	P15090	132 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CMPK1	P30085	196 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ETV6	P41212	452 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	DNAJB13	P59910	316 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	S100A12	P80511	92 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SMCO1	Q147U7	214 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SPINK9	Q5DT21	86 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	AP1S3	Q96PC3	154 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CST11	Q9H112	138 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CALML5	Q9NZT1	146 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	JPT1	Q9UK76	154 aa		0.45	□□□□□ -2.34

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