RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 GPX1P07203 203 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 OR10J4P0C629 311 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 GAGE12FP0CL80 117 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 GAGE12GP0CL81 117 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 GAGE12IP0CL82 117 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PET100P0DJ07 73 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 H2BFSP57053 126 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PDE6HQ13956 83 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 ODF3Q96PU9 254 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PAXXQ9BUH6 204 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 RYR1P21817 5038 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 HSPG2P98160 4391 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 MUC4Q99102 2169 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 OR7C2O60412 319 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 MPC2O95563 127 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 IFNA5P01569 189 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 CSN1S1P47710 185 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 CCL18P55774 89 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 RNF141Q8WVD5 230 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ATP5SQ99766 215 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 A0A0J9YY99 117 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 C7orf71A4D174 169 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 RGS13O14921 159 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 RTL8CO15255 209 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 RANP62826 216 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 CD300CQ08708 224 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 VGLL1Q99990 258 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 BATF3Q9NR55 127 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 FUT9Q9Y231 359 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 HSPB11Q9Y547 144 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 M6PRP20645 277 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R45P59539 299 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 BTN1A1Q13410 526 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZR54 194 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 FXYD5Q96DB9 178 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 MBD2Q9UBB5 411 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PPV4 95 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 KLLNB2CW77 178 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 NMBP08949 121 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ZNF138P52744 262 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 KHDC3LQ587J8 217 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZTI0 123 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 SSX7Q7RTT5 188 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 HYLS1Q96M11 299 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 Q9H3A6 140 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ZNF492Q9P255 531 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 CRISP2P16562 243 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 HOXA5P20719 270 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 Q9H8V8 135 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 RBAKDNA6NC62 111 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 PGPA6NDG6 321 aa6.28□□□□□ -1.4
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