RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.97□□□□□ -0.49
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PACSIN3-210ENST00000533686 Q8TAT8 98 aa11.91□□□□□ -0.5
PACSIN3-210ENST00000533686 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.91□□□□□ -0.5
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PACSIN3-210ENST00000533686 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.9□□□□□ -0.5
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PACSIN3-210ENST00000533686 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PACSIN3-210ENST00000533686 ATP5G3P48201 142 aa11.9□□□□□ -0.5
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PACSIN3-210ENST00000533686 Q8NAQ8 132 aa11.9□□□□□ -0.5
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.9□□□□□ -0.5
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.9□□□□□ -0.5
PACSIN3-210ENST00000533686 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
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PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.89□□□□□ -0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 C7orf71A4D174 169 aa11.89□□□□□ -0.51
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PACSIN3-210ENST00000533686 J3KRW8 73 aa11.88□□□□□ -0.51
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PACSIN3-210ENST00000533686 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.88□□□□□ -0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.88□□□□□ -0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.87□□□□□ -0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A0J9YWU9 116 aa11.87□□□□□ -0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 BCL2P10415 239 aa11.87□□□□□ -0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 TAS2R60P59551 318 aa11.87□□□□□ -0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 BTN1A1Q13410 526 aa11.87□□□□□ -0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 RRN3P1Q2M238 152 aa11.87□□□□□ -0.51
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