RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525725.5

PACSIN3-203, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-203ENST00000525725 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 CCL18P55774 89 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 TNP2Q05952 138 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 HSPB11Q9Y547 144 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 NDUFB4O95168 129 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 HOXA5P20719 270 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 LEPP41159 167 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 PDE6HQ13956 83 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 C6orf223Q8N319 242 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-203ENST00000525725 KLLNB2CW77 178 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 H3BNG1 76 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 M0R3E3 92 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 M6PRP20645 277 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 Q5BKY6 102 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 SSX7Q7RTT5 188 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 C18orf15Q96N68 181 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 ATP5SQ99766 215 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 UPK3BQ9BT76 320 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 MPDU1O75352 247 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 WFDC1Q9HC57 220 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 SNURFLB1AK76 121 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 GAGE12BA1L429 117 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 C7orf71A4D174 169 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 GAGE7O76087 117 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 GAGE12FP0CL80 117 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 GAGE12GP0CL81 117 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 GAGE12IP0CL82 117 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 PYYP10082 97 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 CRISP2P16562 243 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 Q6ZTI0 123 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 Q9H3A6 140 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 PRELID1Q9Y255 219 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 J3KRW8 73 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-203ENST00000525725 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 TTC32Q5I0X7 151 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 CDK2AP2O75956 126 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 IFNA5P01569 189 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 ERCC8Q13216 396 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 BTN1A1Q13410 526 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 OR5I1Q13606 314 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 A0A0J9YY99 117 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 NMBP08949 121 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 CD300CQ08708 224 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 LINC00477Q96M19 166 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 Q9H8V8 135 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 A0A1W2PPQ1 181 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 C16orf90A8MZG2 172 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 TCL1AP56279 114 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 ESRGQ1W209 222 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 PRR9Q5T870 116 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 ASB13Q8WXK3 278 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 AQP10Q96PS8 301 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 G3V3Q6 166 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 SPINK4O60575 86 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 BLNKQ8WV28 456 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 FXYD5Q96DB9 178 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-203ENST00000525725 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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