RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500576.4

LYRM4-208, Transcript of LYR motif containing 4, human

TSL 2 BASIC

Gene LYRM4, Length 592 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM4-208	ENST00000500576	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		A0A1B0GW15	77 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		M0QZK8	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	NPFF	O15130	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	BUB3	O43684	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		P01737	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CD24	P25063	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SRI	P30626	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SAA4	P35542	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CTRL	P40313	264 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	HBB	P68871	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		Q6AWC8	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		B4DSR2	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		J3QLI3	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		K7EQM0	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	IGF1	P05019	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	RAB4A	P20338	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	ATP5J2	P56134	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	TCL1A	P56279	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SLC35B1	P78383	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	DEFA6	Q01524	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	HES1	Q14469	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	PRR25	Q96S07	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		U3KQK5	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		H3BUA1	57 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SPINK4	O60575	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHG2	P01859	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	PMCH	P20382	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		A0A096LNT2	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		A0A1B0GUT8	65 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		A6NDX4	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		H3BTX0	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		M0R3E3	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	CLEC3B	P05452	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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