RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MLST8	Q9BVC4	326 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SH2D1A	O60880	128 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MGP	P08493	103 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX6A1	P12074	109 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEC61G	P60059	68 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	BPTF	Q12830	3046 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	AGRN	O00468	2067 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFC2	O95298	119 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPC2	P61916	151 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	CACNA1H	O95180	2353 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	hADV29S1	A0JD25	119 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPP1R17	O96001	155 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2D3	P61077	147 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2D2	P62837	147 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL11RA	Q14626	422 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549		F8WDY8	70 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	WNT9B	O14905	357 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MORN5	Q5VZ52	161 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	LEAP2	Q969E1	77 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	PEMT	Q9UBM1	199 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	PI4KA	P42356	2102 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF785	A8K8V0	405 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL3	P10147	92 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXCL12	P48061	93 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PR77	199 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	FHL3	Q13643	280 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXCL10	P02778	98 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	EFNA4	P52798	201 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	NXPH1	P58417	271 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01587	Q99440	93 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCKAP5	O14513	1909 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0B4J2C4	111 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAL	P21145	153 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A096LNJ9	63 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB119	Q8N690	84 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOCK7	Q96N67	2140 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549		F5H697	171 aa		6.46	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2D1	P51668	147 aa		6.46	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf195	Q5TG92	126 aa		6.46	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		6.46	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549		J3QLI3	93 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	APELA	P0DMC3	54 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549		P0DMU3	169 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM231A	P0DMU4	169 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM231C	P0DMU5	169 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOLR3	P41439	243 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZMAT4	Q9H898	229 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549		U3KQK5	164 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	THADA	Q6YHU6	1953 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR7	Q8TB68	274 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM131	Q92545	1883 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIP4P1	Q86T03	277 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	JPT2	Q9H910	190 aa		6.45	□□□□□ -1.38

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