RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 OR9G1Q8NH87 305 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 FMC1Q96HJ9 113 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 LYPD3O95274 346 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf74Q32Q52 190 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 CLECL1Q8IZS7 167 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf95Q9H693 158 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 CACNG5Q9UF02 275 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf70A6NJV1 201 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHG1P01857 330 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00596Q86U02 117 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 TEN1Q86WV5 123 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 U3KQE9 123 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 PAX4O43316 350 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 NXPH3O95157 252 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 GASTP01350 101 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMB8P28062 276 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 EBI3Q14213 229 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFB2O95178 105 aa3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 NCR2O95944 276 aa3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 MDP1Q86V88 176 aa3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXB1Q99853 325 aa3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 GNG13Q9P2W3 67 aa3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLL5B9A064 214 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 TCRAP04437 139 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 COX7CP15954 63 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 CEND1Q8N111 149 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf50Q96LR7 162 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 SPACA5Q96QH8 159 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMM23O14925 209 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP5G1P05496 136 aa3.58□□□□□ -1.84
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RABGGTB-213ENST00000496055 CTXN1P60606 82 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM187Q14656 261 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 MMD2Q8IY49 270 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 C7orf69Q9H7B7 122 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 hADV29S1A0JD25 119 aa3.58□□□□□ -1.84
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RABGGTB-213ENST00000496055 BUB3O43684 328 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL1P22362 96 aa3.58□□□□□ -1.84
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RABGGTB-213ENST00000496055 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 C17orf77Q96MU5 243 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 ROS1P08922 2347 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 MED12LQ86YW9 2145 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 RTTNQ86VV8 2226 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 TCL1BO95988 128 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 SAA4P35542 130 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF134P52741 427 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 GFI1Q99684 422 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCA1O95477 2261 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 FREM3P0C091 2139 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP92A6NM28 416 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 A8MWV9 139 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV3-15P01624 115 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV1-44P01699 117 aa3.57□□□□□ -1.84
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