RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494977.1

FGD4-208, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 2

Gene FGD4, Length 2,349 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-208	ENST00000494977	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TCF15	Q12870	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	S1PR3	Q99500	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977		Q9UFV3	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	COX6C	P09669	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	CCL11	P51671	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	LOXL3	P58215	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	CD69	Q07108	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	FOXF2	Q12947	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977		Q9H3A6	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977		A0A0J9YY99	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	ELANE	P08246	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	VEGFB	P49765	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	LAGE3	Q14657	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977		Q6ZT83	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977		H7C423	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977		J3QT63	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	CCL16	O15467	120 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	COX6B1	P14854	86 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	NBL1	P41271	181 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	ZNF134	P52741	427 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	LINC00205	P59089	165 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-208	ENST00000494977	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977		H7C2G1	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SSR4	P51571	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SPINT2	O43291	252 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	FSTL3	O95633	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PROK2	Q9HC23	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	FOXB1	Q99853	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977		A0A0U1RQV1	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	UPK2	O00526	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PLAU	P00749	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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