RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 IGKCP01834 107 aa8.5□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 FABP2P12104 132 aa8.5□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 PRTN3P24158 256 aa8.5□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.5□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.5□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 OOSP1A8MZH6 123 aa8.5□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 ABCA1O95477 2261 aa8.5□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 GAS8-AS1O95177 125 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 ORM1P02763 201 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 HLA-DMBP28068 263 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 RAB9AP51151 201 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 RAB37Q96AX2 223 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 TM2D2Q9BX73 214 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 FXYD2P54710 66 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 TCTAP57738 103 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 HES1Q14469 280 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 C18orf15Q96N68 181 aa8.49□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 KLRD1Q13241 179 aa8.48□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 DPM2O94777 84 aa8.48□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 DTX2Q86UW9 622 aa8.48□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.48□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.48□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 A0A1W2PRD5 423 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 A0A1W2PRF3 423 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 A0A1W2PRM7 423 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 IGHV3-23P01764 117 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 GCSHP23434 173 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 ERCC8Q13216 396 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 TAL2Q16559 108 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 CEND1Q8N111 149 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 FOXC2Q99958 501 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 ROS1P08922 2347 aa8.47□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.46□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 PRAC2D3DTV9 90 aa8.46□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 BUB3O43684 328 aa8.46□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 PRSS1P07477 247 aa8.46□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 RIPPLY3P57055 190 aa8.46□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.46□□□□□ -1.05
NEB-215ENST00000489048 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.46□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 NRACQ8N912 160 aa8.46□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.46□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TIMD4Q96H15 378 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TMEM238C9JI98 176 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 LINC01560Q8TB33 94 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 A0A087WX48 190 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 E9PLD3 99 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 LINC01619G3V211 115 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 LAGE3Q14657 143 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TM4SF20Q53R12 229 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 Q8N9W7 124 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.45□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.44□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TRGV3P03979 118 aa8.44□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TMEM11P17152 192 aa8.44□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.44□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.44□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.44□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.44□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.43□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.43□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 ZZEF1O43149 2961 aa8.43□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.43□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 GOSR1O95249 250 aa8.43□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 PLNP26678 52 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms