RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 HES1Q14469 280 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 GTSF1Q8WW33 167 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 COX11Q9Y6N1 276 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-48P01763 117 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 IGLL1P15814 213 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 CSN1S1P47710 185 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 LCN12Q6JVE5 192 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 A6NJY4 79 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 NDPQ00604 133 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 PSMG4Q5JS54 123 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 PRNTQ86SH4 94 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 ATOH7Q8N100 152 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 STPG4Q8N801 248 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 DPF1Q92782 380 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFB8O95169 186 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 CNIH1O95406 144 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 TFPI2P48307 235 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 PTTG1IPP53801 180 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 PSG9Q00887 426 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 PSG3Q16557 428 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 LEMD1Q68G75 181 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 FA2HQ7L5A8 372 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 RNF125Q96EQ8 232 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV1-17P01599 117 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV2-11P01706 119 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2V1Q13404 147 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01545Q5VT33 79 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 ARPC1AQ92747 370 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 PSG8Q9UQ74 426 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1A-208ENST00000486964 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01548A6NM66 108 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 K7EIM0 57 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 TCF21O43680 179 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 29.8
POLR1A-208ENST00000486964 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 THYN1Q9P016 225 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 H3BUX3 64 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 BRI3O95415 125 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 MFAP4P55083 255 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 Q6YL49 198 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 SGK494Q96LW2 274 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 PLXNB1O43157 2135 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 CR1P17927 2039 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 K7EP13 123 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 GNG7O60262 68 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 IGHG2P01859 326 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 IGF1P05019 195 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 IL4P05112 153 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 APELAP0DMC3 54 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 BMI1P35226 326 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-208ENST00000486964 RAB9AP51151 201 aa7.44□□□□□ -1.22
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