RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 HYLS1Q96M11 299 aa3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 RNF2Q99496 336 aa3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 TM2D3Q9BRN9 247 aa3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 PDCD10Q9BUL8 212 aa3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 C20orf85Q9H1P6 137 aa3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 VSIRQ9H7M9 311 aa3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 STARD9Q9P2P6 4700 aa3□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF320A2RRD8 509 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 K7EMT4 169 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 GNG7O60262 68 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFNA7P01567 189 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFNA17P01571 189 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 TCRBP04435 133 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4E1P0C645 316 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 IAPPP10997 89 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC25A6P12236 298 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 NPY1RP25929 384 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 BMI1P35226 326 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 RND2P52198 227 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 AP3S2P59780 193 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 ERHP84090 104 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRR4Q16378 134 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 GUCA2BQ16661 112 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 HAGHQ16775 308 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRIQKQ629K1 86 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 LCN12Q6JVE5 192 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 TEX261Q6UWH6 196 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC16A13Q7RTY0 426 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DEFB125Q8N687 156 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR1L6Q8NGR2 347 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4X1Q8NH49 305 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DTD1Q8TEA8 209 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 MITD1Q8WV92 249 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 TXN2Q99757 166 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 MAGT1Q9H0U3 335 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 EDA2RQ9HAV5 297 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SMPXQ9UHP9 88 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 U3KQ87 197 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV25A0A0B4J276 109 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 CEBPZOSA8MTT3 80 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 H3BP45 60 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 CORTO00230 105 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SYNGR2O43760 224 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATG12O94817 140 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV2D-28P01615 120 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 CRYBB3P26998 211 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SNCAP37840 140 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 OPRK1P41145 380 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF90Q03938 601 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 GAMTQ14353 236 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 COMMD7Q86VX2 200 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DUSP18Q8NEJ0 188 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR1S1Q8NH92 325 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DCANP1Q8TF63 244 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SCGB3A2Q96PL1 93 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 C20orf24Q9BUV8 137 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SRD5A3Q9H8P0 318 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 U3KQK5 164 aa2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 RYR2Q92736 4967 aa2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR11H12B2RN74 326 aa2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SCO1O75880 301 aa2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 MBP02144 154 aa2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC25A4P12235 298 aa2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 ANXA3P12429 323 aa2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR10J1P30954 320 aa2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 AKR1D1P51857 326 aa2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 DEFB1P60022 68 aa2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC10-211ENST00000485621 BTN1A1Q13410 526 aa2.97□□□□□ -1.93
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