RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 OR5A2Q8NGI9 324 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 OR5D16Q8NGK9 328 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC77Q9BR77 488 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM133Q9H2Q1 129 aa-1.48□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 LINC00467Q9BRT7 94 aa-1.51□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 OR51I1Q9H343 314 aa-1.51□□□□□ -2.65
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