RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 NUDT11Q96G61 164 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 RAX2Q96IS3 184 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 FAM210BQ96KR6 192 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ASCL2Q99929 193 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 BIN3Q9NQY0 253 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 MLXQ9UH92 298 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ACANP16112 2415 aa7.2□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 NOTCH2Q04721 2471 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ERCC8Q13216 396 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 PRR27Q6MZM9 219 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 Q8TAT8 98 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 DCANP1Q8TF63 244 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 C8orf49Q96NF6 230 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 PRR25Q96S07 402 aa7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1W2PPQ1 181 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1W2PRX2 142 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 M0QZ24 198 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 CCL24O00175 119 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 OVOL1O14753 267 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 TYMSP04818 313 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 CSN3P07498 182 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 CRIP1P50238 77 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP10-3P60369 221 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF738Q8NE65 137 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 PEMTQ9UBM1 199 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ZFHX3Q15911 3703 aa7.18□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 HIVEP2P31629 2446 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 K7EQG2 157 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF138P52744 262 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 CT83Q5H943 113 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.17□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1B0GUS0 222 aa7.16□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 P01737 135 aa7.16□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ID1P41134 155 aa7.16□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 TCL1AP56279 114 aa7.16□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB1P60022 68 aa7.16□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 TSKUQ8WUA8 353 aa7.16□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 BTF3L4Q96K17 158 aa7.16□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.16□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 PHOX2AO14813 284 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 SH2D1AO60880 128 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 CT45A10P0DMU9 189 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 TFPI2P48307 235 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00477Q96M19 166 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 NEU1Q99519 415 aa7.15□□□□□ -1.26
SRPRB-202ENST00000466636 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 A8MWL6 223 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 F6UB75 175 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 RAB5BP61020 215 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 SMUG1Q53HV7 270 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.14□□□□□ -1.27
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