RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.65□□□□□ -0.55
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PTPRU-204ENST00000428026 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.58□□□□□ -0.56
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PTPRU-204ENST00000428026 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.58□□□□□ -0.56
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PTPRU-204ENST00000428026 TMEM141Q96I45 108 aa11.56□□□□□ -0.56
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PTPRU-204ENST00000428026 PRR25Q96S07 402 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRU-204ENST00000428026 SPANXCQ9NY87 97 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRU-204ENST00000428026 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRU-204ENST00000428026 HAMPP81172 84 aa11.56□□□□□ -0.56
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