RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 GAS8-AS1O95177 125 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC01620Q4KN68 170 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 KLK15Q9H2R5 256 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 COL4A6Q14031 1691 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC01619G3V211 115 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 CFC1BP0CG36 223 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 CFC1P0CG37 223 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.68□□□□□ -1.34
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NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 DPH3Q96FX2 82 aa6.68□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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NHLRC3-201ENST00000379599 UTF1Q5T230 341 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 LEAP2Q969E1 77 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 ABCA1O95477 2261 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 CXCL10P02778 98 aa6.67□□□□□ -1.34
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NHLRC3-201ENST00000379599 ATXN8Q156A1 80 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 Q8IYB0 196 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 JPT2Q9H910 190 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 H7C1H1 209 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 OVOL1O14753 267 aa6.67□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 TFF2Q03403 129 aa6.67□□□□□ -1.34
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NHLRC3-201ENST00000379599 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.66□□□□□ -1.34
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NHLRC3-201ENST00000379599 PRDX2P32119 198 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC01559Q495D7 138 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM186AA6NE01 2351 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 PRCDQ00LT1 54 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 OTORQ9NRC9 128 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 CTSZQ9UBR2 303 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.66□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.65□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF785A8K8V0 405 aa6.65□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 F8VRH5 84 aa6.65□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 CXCL13O43927 109 aa6.65□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 CNTFRP26992 372 aa6.65□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF415Q09FC8 603 aa6.65□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 C2orf83Q53S99 150 aa6.65□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.65□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.65□□□□□ -1.34
NHLRC3-201ENST00000379599 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.65□□□□□ -1.34
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NHLRC3-201ENST00000379599 PRO0628Q9UI54 55 aa6.65□□□□□ -1.34
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NHLRC3-201ENST00000379599 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.65□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 PLXNB1O43157 2135 aa6.65□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 IGLV2-11P01706 119 aa6.65□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 CRIP1P50238 77 aa6.65□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 DLX6P56179 175 aa6.65□□□□□ -1.35
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NHLRC3-201ENST00000379599 WDR86Q86TI4 376 aa6.65□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 C8orf49Q96NF6 230 aa6.65□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 SPANXCQ9NY87 97 aa6.65□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 OXTP01178 125 aa6.64□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF883P0CG24 379 aa6.64□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 MALP21145 153 aa6.64□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 Q8N8P6 123 aa6.64□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.64□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.64□□□□□ -1.35
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NHLRC3-201ENST00000379599 Q5XG85 94 aa6.64□□□□□ -1.35
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NHLRC3-201ENST00000379599 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.64□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 METRNQ9UJH8 293 aa6.64□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.63□□□□□ -1.35
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NHLRC3-201ENST00000379599 IGHG3P01860 377 aa6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 TDHQ8IZJ6 230 aa6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 V9GYY9 64 aa6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 LAGE3Q14657 143 aa6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 CRYGAP11844 174 aa6.63□□□□□ -1.35
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM240Q5SV17 173 aa6.63□□□□□ -1.35
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