RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361909.8

CMTM3-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-201ENST00000361909 CCL17Q92583 94 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 DKK2Q9UBU2 259 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 TMEM213A2RRL7 107 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 IGKCP01834 107 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 FCER1GP30273 86 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 CRYGBP07316 175 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 CCL3L1P16619 93 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 NPYP01303 97 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 TWIST1Q15672 202 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 MTURNQ8N3F0 131 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.92□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 IGLL5B9A064 214 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 SH2D1AO60880 128 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 DPM2O94777 84 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 GOSR1O95249 250 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 TM4SF20Q53R12 229 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 DTX2Q86UW9 622 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF479Q96JC4 524 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.91□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 LINC01619G3V211 115 aa14.9□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 I3L2K1 104 aa14.9□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.9□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.9□□□□□ -0.02
CMTM3-201ENST00000361909 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa14.89□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 TEX22C9J3V5 150 aa14.89□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 C19orf84I3L1E1 186 aa14.89□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 TCTAP57738 103 aa14.89□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF843Q8N446 348 aa14.89□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 CNFNQ9BYD5 112 aa14.89□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 IGKV1-17P01599 117 aa14.88□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 IGLC6P0CF74 106 aa14.88□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.88□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 ABCA4P78363 2273 aa14.88□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 K7ERJ3 54 aa14.88□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 C8orf49Q96NF6 230 aa14.88□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.88□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 RBP4P02753 201 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 SCGB2A2Q13296 93 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 ARPC1AQ92747 370 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 MRAP2Q96G30 205 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 NDUFB3O43676 98 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 PRB1P04280 392 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 LEPP41159 167 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 WFDC2Q14508 124 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 GAGE13Q4V321 117 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 RNF125Q96EQ8 232 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 C18orf15Q96N68 181 aa14.87□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 PRSS1P07477 247 aa14.86□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 CKS1BP61024 79 aa14.86□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.86□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.86□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 DLX6P56179 175 aa14.85□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 FXYD7P58549 80 aa14.85□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 C17orf77Q96MU5 243 aa14.85□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 A0A1B0GWB2 263 aa14.85□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 A0A1W2PPR1 153 aa14.85□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 RAB9AP51151 201 aa14.85□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 C12orf74Q32Q52 190 aa14.85□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.85□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 RRN3P1Q2M238 152 aa14.84□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.84□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.84□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.84□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.84□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 RNF185Q96GF1 192 aa14.84□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 RNF5Q99942 180 aa14.84□□□□□ -0.03
CMTM3-201ENST00000361909 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.83□□□□□ -0.04
CMTM3-201ENST00000361909 SMKR1H3BMG3 65 aa14.83□□□□□ -0.04
CMTM3-201ENST00000361909 PRR25Q96S07 402 aa14.83□□□□□ -0.04
CMTM3-201ENST00000361909 PRO0461Q9UI25 63 aa14.83□□□□□ -0.04
CMTM3-201ENST00000361909 M0R3E3 92 aa14.83□□□□□ -0.04
CMTM3-201ENST00000361909 Q8N8P6 123 aa14.83□□□□□ -0.04
CMTM3-201ENST00000361909 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.83□□□□□ -0.04
CMTM3-201ENST00000361909 FOXC2Q99958 501 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms