RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 C18orf15Q96N68 181 aa6.62□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 PRR25Q96S07 402 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 CNFNQ9BYD5 112 aa6.62□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.62□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 LY6LH3BQJ8 138 aa6.62□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 SMIM13P0DJ93 91 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 PSMG4Q5JS54 123 aa6.62□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 GAS8-AS1O95177 125 aa6.61□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 ROS1P08922 2347 aa6.61□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.61□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 C16orf97H3BN30 126 aa6.61□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 SCGB2A2Q13296 93 aa6.61□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 PLGLAQ15195 96 aa6.61□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 TWIST1Q15672 202 aa6.61□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 IGHG4P01861 327 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 HLA-DRB4P13762 266 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 EVI2AP22794 236 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 GCSHP23434 173 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 Q8TAT8 98 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 RPEQ96AT9 228 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.6□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.6□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.6□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 LEPP41159 167 aa6.6□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 VGLL1Q99990 258 aa6.6□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.59□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.59□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 E9PLD3 99 aa6.59□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 TIMM23O14925 209 aa6.59□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 GNG7O60262 68 aa6.59□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 IGKCP01834 107 aa6.59□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 COX7A1P24310 79 aa6.59□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
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UBQLN3-201ENST00000311659 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.59□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 CEND1Q8N111 149 aa6.59□□□□□ -1.35
UBQLN3-201ENST00000311659 CCL21O00585 134 aa6.58□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 NDUFA3O95167 84 aa6.58□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 CFHR4Q92496 578 aa6.58□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.58□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 A0A1W2PRM7 423 aa6.58□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 E7EQL1 145 aa6.58□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 NBR2O15453 112 aa6.58□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.58□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 NPBQ8NG41 125 aa6.58□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.58□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP5LO75964 103 aa6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 DPM2O94777 84 aa6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 HLA-DMBP28068 263 aa6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 MFAP4P55083 255 aa6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 Q8N8P6 123 aa6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 FOXC2Q99958 501 aa6.57□□□□□ -1.36
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