RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 TM4SF20Q53R12 229 aa13.45□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 H3BUT2 72 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 EVI2AP22794 236 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF562Q6V9R5 426 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 RAB37Q96AX2 223 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 RNF185Q96GF1 192 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 SAP30O75446 220 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 KIR3DS1Q14943 382 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM190Q8WZ59 177 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 DPF1Q92782 380 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 A1L4Q6 167 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 GAGE10A6NGK3 116 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 ODF3BA8MYP8 253 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 CDSNQ15517 529 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 RNF182Q8N6D2 247 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 CEACAM3P40198 252 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 TTC9CQ8N5M4 171 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.43□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa13.41□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.41□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa13.41□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.41□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 S100A7AQ86SG5 101 aa13.41□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 ATRXP46100 2492 aa13.41□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 C9orf118A6NHY6 69 aa13.41□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 VKORC1Q9BQB6 163 aa13.41□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 BMI1P35226 326 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 LEPP41159 167 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 HSD52Q0P140 79 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 IL17RELQ6ZVW7 336 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 A6NDN8 102 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 H3BRM9 83 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 PRTN3P24158 256 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 COTL1Q14019 142 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 AP1S3Q96PC3 154 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 A0A0G2JLM5 398 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 MAP1LC3AQ9H492 121 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 VPS13CQ709C8 3753 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TNFRSF6BO95407 300 aa13.38□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 Q8N6K4 173 aa13.38□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa13.38□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZQT7 251 aa13.38□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.38□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM11P17152 192 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 S100A7P31151 101 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ODF1Q14990 250 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 AKAP6Q13023 2319 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 M0R1W7 72 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TRGV3P03979 118 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ECSCRQ19T08 205 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 C15orf32Q32M92 178 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TIMD4Q96H15 378 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CNFNQ9BYD5 112 aa13.36□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.36□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.36□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 K7EP34 96 aa13.36□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 FOXC1Q12948 553 aa13.36□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 DTX2Q86UW9 622 aa13.36□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 K7EMI3 77 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 K7ERU9 68 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 PRSS1P07477 247 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 OR4X2Q8NGF9 303 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 IGF2RP11717 2491 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CLEC3BP05452 202 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 FXYD2P54710 66 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ZFAND3Q9H8U3 227 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 MSRB2Q9Y3D2 182 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SIVA1O15304 175 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 FCER1GP30273 86 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 Q8N9W7 124 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 K7ERJ3 54 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 BUB3O43684 328 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GCSHP23434 173 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 RIPPLY3P57055 190 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4A-201ENST00000293683 LINC01559Q495D7 138 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms