RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 COL7A1Q02388 2944 aa14.66□□□□□ -0.06
KDELR3-201ENST00000216014 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.66□□□□□ -0.06
KDELR3-201ENST00000216014 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.66□□□□□ -0.06
KDELR3-201ENST00000216014 STHQ8IWL8 128 aa14.66□□□□□ -0.06
KDELR3-201ENST00000216014 CSN1S1P47710 185 aa14.65□□□□□ -0.06
KDELR3-201ENST00000216014 RAB14P61106 215 aa14.65□□□□□ -0.06
KDELR3-201ENST00000216014 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.65□□□□□ -0.06
KDELR3-201ENST00000216014 ATG101Q9BSB4 218 aa14.65□□□□□ -0.06
KDELR3-201ENST00000216014 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 M0R2Z0 102 aa14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 IFNA1P01562 189 aa14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 TUBA4BQ9H853 241 aa14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 PRR9Q5T870 116 aa14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 Q6ZQT7 251 aa14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 A8MZ25 164 aa14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 C11orf52Q96A22 123 aa14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 RBAKDNA6NC62 111 aa14.62□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.62□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 J3KRW8 73 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF492Q9P255 531 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 MRAPQ8TCY5 172 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 C8orf49Q96NF6 230 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 PSG8Q9UQ74 426 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF138P52744 262 aa14.6□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 PRNTQ86SH4 94 aa14.6□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 Q86TA4 180 aa14.6□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.6□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.6□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 RAB19A4D1S5 217 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 LINC00477Q96M19 166 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 XCL2Q9UBD3 114 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 AKR1C3P42330 323 aa14.58□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.58□□□□□ -0.07
KDELR3-201ENST00000216014 F6UZH7 168 aa14.58□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 PDE6DO43924 150 aa14.58□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.58□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.58□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.58□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 RETNQ9HD89 108 aa14.58□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 MED9Q9NWA0 146 aa14.58□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.57□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 BTN1A1Q13410 526 aa14.57□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.57□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.57□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.57□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 CSTL1Q9H114 145 aa14.57□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 LINC00862A6NCI5 91 aa14.56□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 CEBPGP53567 150 aa14.56□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.56□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 KLLNB2CW77 178 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 IGLV2-8P01709 118 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 PRM2P04554 102 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 CRISP2P16562 243 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 COMMD7Q86VX2 200 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 ODF3Q96PU9 254 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 LTAP01374 205 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 FMC1Q96HJ9 113 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 PARLQ9H300 379 aa14.55□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 DEFB135Q30KP9 77 aa14.54□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.54□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM250H0YL14 139 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 K7EQM0 130 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 CDKN1BP46527 198 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 CRIP1P50238 77 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 CENPWQ5EE01 88 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-201ENST00000216014 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.53□□□□□ -0.08
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