RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	NDUFB8	O95169	186 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	CT83	Q5H943	113 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	STPG4	Q8N801	248 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A1B0GXF2	115 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	C20orf202	A1L168	122 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481		Q6ZN92	141 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	TXN2	Q99757	166 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF492	Q9P255	531 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481		M0R2Z0	102 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	TOMM40	O96008	361 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481		A8MWL6	223 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	PLP1	P60201	277 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	HBB	P68871	147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481		I3L2K1	104 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	TSPO	P30536	169 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	CAMP	P49913	170 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	MTOR	P42345	2549 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481		P01737	135 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	GP9	P14770	177 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481		K7EIM0	57 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	LTA	P01374	205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481		G3V318	75 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	TCRA	P04437	139 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481		Q9H3A6	140 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	C2orf70	A6NJV1	201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	OTOR	Q9NRC9	128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM231B	A6NCW3	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	BLCAP	P62952	87 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481		S4R3C0	116 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	TCF21	O43680	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481		Q6YL49	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481		Q6ZS46	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	SGK494	Q96LW2	274 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	LCN12	Q6JVE5	192 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	CD5L	O43866	347 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	MAJIN	Q3KP22	176 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481		Q56UQ5	140 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	ATOH7	Q8N100	152 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHG2	P01859	326 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	LYZ	P61626	148 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481		Q86TA4	180 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	COX11	Q9Y6N1	276 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	CUBN	O60494	3623 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-208	ENST00000638481	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms