RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601252.1

TIMM50-215, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 1,737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-215ENST00000601252 H3BTX0 84 aa11.12□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 GATA3P23771 443 aa11.12□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 TCF24Q7RTU0 167 aa11.12□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.12□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 SGK494Q96LW2 274 aa11.12□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.12□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.12□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.12□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa11.11□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 A0A1B0GUT8 65 aa11.11□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 C20orf202A1L168 122 aa11.11□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 TCAPO15273 167 aa11.11□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 ATP6V0E1O15342 81 aa11.11□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.11□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 GTSF1Q8WW33 167 aa11.11□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.11□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 ATP6V0BQ99437 205 aa11.11□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.635e-6■■■■□ 22.8
TIMM50-215ENST00000601252 M0R2Z0 102 aa11.1□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 GATD1Q8NB37 220 aa11.1□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 F8W735 103 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 OR5AL1P0C617 328 aa11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 NTF3P20783 257 aa11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 RPS20P60866 119 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 ECSCRQ19T08 205 aa11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 NIT1Q86X76 327 aa11.09□□□□□ -0.63
TIMM50-215ENST00000601252 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 C3orf79P0CE67 100 aa11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 PAM16Q9Y3D7 125 aa11.08□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.07□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 CTSGP08311 255 aa11.07□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.07□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 BMI1P35226 326 aa11.07□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 NRGNQ92686 78 aa11.07□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 S4R3C0 116 aa11.07□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 A1L4Q6 167 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 OR2T8A6NH00 312 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 PCP4P48539 62 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 PIFOQ8TCI5 191 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 MAST4O15021 2626 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 A0A087X0K7 114 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 APOHP02749 345 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 C15orf32Q32M92 178 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 TMEM219Q86XT9 240 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 Q8N976 141 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 C17orf77Q96MU5 243 aa11.06□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 CENPEQ02224 2701 aa11.05□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 J3QLI3 93 aa11.05□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 RHOGP84095 191 aa11.05□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 SPATA45Q537H7 98 aa11.05□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.05□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.05□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.05□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 CR1P17927 2039 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 A0A096LNT2 108 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 TMEM189A5PLL7 270 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 RBAKDNA6NC62 111 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 LINC00614P0C842 121 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 CD33P20138 364 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 SPG11Q96JI7 2443 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 A6NDX4 124 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 IGHV3-23P01764 117 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 CTRLP40313 264 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.04□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 FAM223BA6NKX1 122 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 G3V318 75 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMM50-215ENST00000601252 M0R3E3 92 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms