RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-210ENST00000561408 CMTM5Q96DZ9 223 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-210ENST00000561408 PRAC1Q96KF2 57 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-210ENST00000561408 SLC29A1Q99808 456 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-210ENST00000561408 RSG1Q9BU20 258 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-210ENST00000561408 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-210ENST00000561408 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 SPINK4O60575 86 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 SLC22A5O76082 557 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 DIRAS3O95661 229 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 LIMS3P0CW19 117 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 LIMS4P0CW20 117 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 RD3LP0DJH9 198 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 CRYGAP11844 174 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 ETV1P50549 477 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 RND2P52198 227 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 ERVK-16P61578 105 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 ERHP84090 104 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 SLAQ13239 276 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 OR2F1Q13607 317 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 SSX1Q16384 188 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 C1orf100Q5SVJ3 147 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 DEFB107AQ8IZN7 70 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF738Q8NE65 137 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 OR5AP2Q8NGF4 316 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 OR52I1Q8NGK6 324 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 SMIM19Q96E16 107 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 TXNDC17Q9BRA2 123 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 PRNDQ9UKY0 176 aa2.65□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 A0A087WZ39 114 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 ATG12O94817 140 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 SNCAP37840 140 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 FXYD4P59646 89 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 FLOT2Q14254 428 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 AADACL3Q5VUY0 350 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 PRSS54Q6PEW0 395 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa2.64□□□□□ -1.99
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TMOD3-210ENST00000561408 SLC25A22Q9H936 323 aa2.64□□□□□ -1.99
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TMOD3-210ENST00000561408 COMMD9Q9P000 198 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa2.64□□□□□ -1.99
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TMOD3-210ENST00000561408 ORM1P02763 201 aa2.63□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
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TMOD3-210ENST00000561408 HSPA13P48723 471 aa2.63□□□□□ -1.99
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TMOD3-210ENST00000561408 HACD4Q5VWC8 232 aa2.63□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 Q6ZQT7 251 aa2.63□□□□□ -1.99
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TMOD3-210ENST00000561408 RAB3CQ96E17 227 aa2.63□□□□□ -1.99
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TMOD3-210ENST00000561408 LINC00477Q96M19 166 aa2.63□□□□□ -1.99
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TMOD3-210ENST00000561408 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa2.63□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 NEBP20929 6669 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 SCGB2A1O75556 95 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 FCGR2CP31995 323 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 HRH1P35367 487 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-210ENST00000561408 LYZP61626 148 aa2.62□□□□□ -1.99
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