RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, human

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTAB-208	ENST00000550718	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SMIM11A	P58511	58 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	UBE2G1	P62253	170 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C6orf99	Q4VX62	202 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C12orf73	Q69YU5	71 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	BAGE3	Q86Y29	109 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	BAGE2	Q86Y30	109 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TSKU	Q8WUA8	353 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ADGRB3	O60242	1522 aa		2.58	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LST1	O00453	97 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	COX7A2P2	O60397	106 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SOD1	P00441	154 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TRBV12-3	P01733	135 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGHV3-7	P01780	117 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SSR2	P43308	183 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF136	P52737	540 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SYNJ2BP	P57105	145 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	UBE2B	P63146	152 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGFBP7	Q16270	282 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	OR5AS1	Q8N127	324 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	MORN4	Q8NDC4	146 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	FGF13	Q92913	245 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF714	Q96N38	554 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TIMM17A	Q99595	171 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	C16orf95	Q9H693	158 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SCN1A	P35498	2009 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ABCC6	O95255	1503 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		2.57	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718		C9JQL5	133 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TCL1B	O95988	128 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGLV3-27	P01718	113 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	HLA-DPB1	P04440	258 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	CD7	P09564	240 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	PCBD1	P61457	104 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	HERVK_113	P61574	105 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LINC00303	Q3SY05	128 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LINC00596	Q86U02	117 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	PCP2	Q8IVA1	136 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SERP2	Q8N6R1	65 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	DCANP1	Q8TF63	244 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	AQP3	Q92482	292 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	RMI2	Q96E14	147 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	AMELY	Q99218	206 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TRGV9	Q99603	122 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TOPBP1	Q92547	1522 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	SHROOM2	Q13796	1616 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		2.56	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718		A0A0J9YXV3	536 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	NDUFC1	O43677	76 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	GLI3	P10071	1580 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	COX8A	P10176	69 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	LAMC1	P11047	1609 aa		2.55	□□□□□ -2
GNPTAB-208	ENST00000550718	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2

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