RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516653.1

RNU6-113P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 113, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-113P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-113P-201ENST00000516653 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 SULT1C2O00338 296 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 GNGT2O14610 69 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 FABP7O15540 132 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 SPINK4O60575 86 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 ATG12O94817 140 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 IGHV3-48P01763 117 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 IGHV3-53P01767 116 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 HLA-DQB1P01920 261 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 IL4P05112 153 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CDK1P06493 297 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 FABP1P07148 127 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 FCGR3AP08637 254 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CD3GP09693 182 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CTXN2P0C2S0 81 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 RD3LP0DJH9 198 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 PSMB9P28065 219 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TALDO1P37837 337 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CBX5P45973 191 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 RPL5P46777 297 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 GALR1P47211 349 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 OR10A3P58181 314 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 DEFB1P60022 68 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 RPL30P62888 115 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CTAG1AP78358 180 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 MT1HP80294 61 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 FGL1Q08830 312 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CATR1Q13166 79 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 RAB31Q13636 194 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 FLOT2Q14254 428 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 MSMO1Q15800 293 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 POU2AF1Q16633 256 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TPRXLQ17RH7 258 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 MAJINQ3KP22 176 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 OR2B11Q5JQS5 317 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 HES5Q5TA89 166 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TMEM236Q5W0B7 351 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 OR2T5Q6IEZ7 315 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 OR8G2PQ6IF36 304 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 ETFRF1Q6IPR1 90 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 AMTNQ6UX39 209 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 C6orf201Q7Z4U5 140 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CROCCP2Q86T23 111 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 BAP18Q8IXM2 172 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 OR8I2Q8N0Y5 310 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 LGI3Q8N145 548 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 ZNF738Q8NE65 137 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 BPIFCQ8NFQ6 507 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TSPAN14Q8NG11 270 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 OR10G4Q8NGN3 311 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 OR1S2Q8NGQ3 325 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 OR2T29Q8NH02 315 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 LYPD6BQ8NI32 183 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 SPACA4Q8TDM5 124 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 DNAJC9Q8WXX5 260 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 BORCS5Q969J3 196 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CMTM5Q96DZ9 223 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 RAB3CQ96E17 227 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 PGLYRP3Q96LB9 341 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 NSMCE2Q96MF7 247 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 GPR82Q96P67 336 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CIB1Q99828 191 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 ARPC5LQ9BPX5 153 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 SIKE1Q9BRV8 207 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 PRADC1Q9BSG0 188 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 CHCHD7Q9BUK0 85 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TMEM109Q9BVC6 243 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TMEM59Q9BXS4 323 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 GTSF1LQ9H1H1 148 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 OR51M1Q9H341 326 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 EFCAB1Q9HAE3 211 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 C12orf4Q9NQ89 552 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 C8orf4Q9NR00 106 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TAS2R4Q9NYW5 299 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 COMMD9Q9P000 198 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 LINC00474Q9P2X8 69 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 AK3Q9UIJ7 227 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 PRNDQ9UKY0 176 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TRAV6A0A075B6T7 132 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 A0A087WX48 190 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TRAV4A0A0B4J268 109 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 MEIS3P1A6NDR6 274 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-113P-201ENST00000516653 SNRPGP15A8MWD9 76 aa0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms