RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516525.1

RNU6-1337P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1337, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1337P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CEP164Q9UPV0 1460 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LYRM1O43325 122 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TCRBP04435 133 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IFNA4P05014 189 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM97Q5BJF2 176 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPTC7Q8NI37 304 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CCDC42Q96M95 316 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NAT8BQ9UHF3 227 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NUP210LQ5VU65 1888 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PIAS1O75925 651 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IFT20Q8IY31 132 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ENY2Q9NPA8 101 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MYCBP2O75592 4640 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MYO7AQ13402 2215 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LPAP08519 4548 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 A0A1W2PRS3 328 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RER1O15258 196 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GYPBP06028 91 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CRHP06850 196 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IDO1P14902 403 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NFYBP25208 207 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ETV6P41212 452 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 COX6A2Q02221 97 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FXYD3Q14802 87 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NEDD8Q15843 81 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AP1S3Q96PC3 154 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRPM7Q96QT4 1865 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DSPPQ9NZW4 1301 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ESPL1Q14674 2120 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 A0A096LNT2 108 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CETN3O15182 167 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMBIM6P55061 237 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ARPP19P56211 112 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 COTL1Q14019 142 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IDO2Q6ZQW0 420 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DDI1Q8WTU0 396 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BTF3L4Q96K17 158 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NCAPD3P42695 1498 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 UNC13BO14795 1591 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PTPN13Q12923 2485 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CXCL1P09341 107 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CEBPGP53567 150 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HACD4Q5VWC8 232 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LINC00269Q8N2A0 174 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SIGMAR1Q99720 223 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EFCAB11Q9BUY7 163 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ANK1P16157 1881 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRAV5A0A0B4J249 113 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 K7ERJ3 54 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HIST1H2BKO60814 126 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BANF1O75531 89 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LYPLA2O95372 231 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HIST1H2BJP06899 126 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM216BQ8N7L0 139 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OR10X1Q8NGY0 326 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CFAP53Q96M91 514 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ASB4Q9Y574 426 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ATP5HO75947 161 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 INSL3P51460 131 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KLKP1Q107X0 134 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SPA17Q15506 151 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LIN52Q52LA3 116 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 Q5XG85 94 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.65□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms