RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf78Q9BR46 151 aa5.76□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.76□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.76□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 FNDC10F2Z333 226 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFB4O95168 129 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5AL1P0C617 328 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 EVI2AP22794 236 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 G6PCP35575 357 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2E1P51965 193 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 TEPPQ6URK8 271 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 GTSF1Q8WW33 167 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 DPM3Q9P2X0 92 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 RABAC1Q9UI14 185 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 CR1P17927 2039 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 ARID1AO14497 2285 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0G2JRQ6 117 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 C9JCJ5 164 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 J3QLI3 93 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 APOMO95445 188 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE13Q4V321 117 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 MRAPQ8TCY5 172 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 ARPC1AQ92747 370 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 RPEQ96AT9 228 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A22Q9H936 323 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 TENM4Q6N022 2769 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 FGF6P10767 208 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR31Q5SQ13 230 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6Q795 121 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 OCC1Q8TAD7 63 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF5Q99942 180 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXC2Q99958 501 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNG5Q9UF02 275 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 V9GYV3 84 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PPI3 338 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 MOSP00540 346 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1D-33P01593 117 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1-33P01594 117 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00205P59089 165 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 PRO0461Q9UI25 63 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 COL12A1Q99715 3063 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 AKAP6Q13023 2319 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 E9PLD3 99 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM262E9PQX1 116 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 LEPROTL1O95214 131 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 DLX1P56177 255 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35B1P78383 322 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01545Q5VT33 79 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZRM9 215 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX45Q8NA69 505 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BMG7 143 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 NPFFO15130 113 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2J3O76001 311 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 IFITM1P13164 125 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R45P59539 299 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 MOB3BQ86TA1 216 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 CFHR4Q92496 578 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 Q96MF0 132 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 PRELID3AQ96N28 172 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4C12Q96R67 309 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 OSTCQ9NRP0 149 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 SPANXCQ9NY87 97 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 PRNDQ9UKY0 176 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.72□□□□□ -1.49
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